南鯤鯓廟有二處引以自豪的蜘蛛結網亭，一在拜殿，一在青山寺拜庭；
蜘蛛結網亭就是「藻井」，有人說是「龍井」。它是由無數的小塊香木榫接而成，按照周易六十四卦三百八十四爻，配合一年四季十二月令廿四節氣與七十二候，所形成的卦氣卦候圖而來的，整體結構奇巧，拼疊緊密，由下往上看，好像蜘蛛結網一樣，實在是建築藝術上的一大巨構。